कथित तौर पर, सुल्तान ने अपने सिर से एक सेल की सलाखों को मारकर या जहर खाकर सुसाइड कर लिया था। इस वर्ज़न को तुर्क इतिहासकारों द्वारा प्रचारित किया गया था। एक वर्ज़न यह भी था कि तैमूर के हुक्म पर बायज़िद को जहर दिया गया था। इसे नामुमकिन माना जाता है, क्योंकि इस बात का सुबूत मौजूद है की उस्मानी हुक्मरानों ने बायज़िद की देखभाल अपने निजी डॉक्टरों को सौंपी थी।

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समकालीनों और वाकेआत के गवाहों की तफ़सील में, न तो किसी सेल और न ही अपमान का जिक्र किया गया है।

कैद के दौरान सुल्तान के साथ जो कुछ भी हुआ उसे वो ज्यादा दिन तक नहीं सह सके अगले कुछ महीनों के अंदर ही दौराने कैद ही उनकी मौत हो गयी थी।